近日，上海大学医学院卞月珉教授与美国哈佛大学医学院Jonathan Abraham教授团队、波士顿大学医学院Rachel Fearns教授团队合作，作为共同作者，在国际顶级期刊《Cell》上发表题为Structural and functional analysis of the Nipah virus polymerase complex的研究论文。
论文链接：https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.12.021
尼帕病毒（Nipah virus, NiV）属于单链负链RNA病毒（nsNSVs），隶属于单股负链病毒目（Mononegavirales）副黏病毒科（Paramyxoviridae），是一种包膜RNA病毒。在人体内，NiV感染可引发严重的呼吸道疾病或致命性脑炎，其病死率介于40%至70%之间。自1998年马来西亚首次发现NiV以来，该病毒几乎每年都会在孟加拉国发生蝙蝠向人类的跨种传播事件。目前，尚无针对NiV的疫苗或特效抗病毒药物，这反映出全球公共卫生防控体系在该病毒防治方面的重大空白。鉴于NiV的高致病性和潜在大流行风险，世界卫生组织（WHO）已将其列入《研发蓝图（R&D Blueprint）》优先病原体名单，强调该领域亟须加速开展研究和应对措施开发。
尼帕病毒聚合酶（NiV polymerase）是病毒基因组复制和mRNA转录的关键酶，被认为是一个极具潜力的抗病毒药物靶点。本研究解析了NiV聚合酶复合物的三维结构，该复合物由大蛋白（L）和磷蛋白（P）组成。L蛋白与P蛋白形成一个稳定的复合物，其中P蛋白呈四聚体螺旋卷曲结构（tetrameric coiled-coil），其末端由一簇⍺-螺旋束封闭，并可能在溶液中保持动态变化。
本研究进一步通过分子动力学模拟系统阐述了该聚合酶的动态特征，P蛋白的各个原体（protomer）相比聚合酶核心（RdRp/CAP）具有更高的结构动态性，其中⍺-螺旋帽结构（⍺-helical cap）的N端区域波动幅度最大；并结合AlphaFold 3（AF3）建模和分子对接研究解析了一种已知L蛋白抑制剂的结合模式，阐明了尼帕病毒对抗病毒药物产生耐药性的机制。
卞月珉教授长期致力于人工智能药物发现的相关研究，2024年8月27日，作为共同第一作者，在《Cell》发表题为Viral DNA polymerase structures reveal mechanisms of antiviral drug resistance的研究论文，系统阐述了HSV聚合酶的结构基础与耐药机制。
卞月珉，上海大学特聘教授，博士生导师，国家级高层次青年人才，上海市海外高层次人才，2024年3月全职加入上海大学医学院。曾担任资深计算科学家，就职于美国麻省理工和哈佛大学布罗德研究所从事新药研发工作。长期致力于人工智能药物发现相关研究，通过开发并整合机器学习与深度学习算法，计算化学与计算生物学策略手段，加速临床前早期药物发现。担任英国国家研究与创新署UKRI、智利国家研究与发展署ANID等机构基金评审外籍专家。近五年，代表性成果发表于Nature、Cell等顶尖学术期刊。
