常用办理流程

1、理工科横向进账合同办理流程

2、理工科横向绩效提取办理流程

3、理工科横向项目结题结转及科研培育基金办理流程

4、理工科横向项目变更负责人办理流程

5、理工科横向补充协议、报价单等用章材料办理流程

6、理工科横向项目预算调整办理流程

7、理工科横向项目外协公示办理流程

常见问题

1、 学校有合同模板吗？

2、 横向进账合同应通过PIM系统还是科研管理系统提交审核？

3、 在科研管理系统上传的合同电子版需要甲方先盖章吗？

4、 合同提交以后，为什么一直没有审核通过？

5、 合同到哪里盖章，需要打印几份？

6、 合同需要交几份原件进行归档？

7、 合同双章扫描件在哪里上传？扫描要注意什么？

8、 申请预开发票或入账时，为什么科研系统提示合同未归档？

9、 横向进账合同的学校管理费比例是多少？

10、 横向进账合同哪些部分不缴纳管理费？

11、 横向进账合同的增值税是多少？

12、 横向进账合同如何办理免税？需要多长时间？

13、 技术服务、技术咨询合同可以免税吗？

14、 合同认定结果如何下载？

15、 学校有补充协议的模板吗？

16、 补充协议可以通过科研管理系统线上审核吗？

17、 横向项目办理结题以后，经费还能用吗？

18、 横向项目结题以后，剩余直接经费可以一次性提取吗？

常用办理流程

1、理工科横向进账合同办理流程

分三个步骤：

第一步，提交待审合同；

第二步，审核、盖章；

第三步，合同归档；

合同归档以后，可办理入账、预开发票等。

第一步，提交待审合同

1.点击上海大学主页右侧一网通办-教学科研，登录科研管理系统。

2.登录科研管理系统后，可选择左上方“科研项目”，点击“新增横向项目”。

或选择右边“快捷通道”，点击“横向项目”。

3.根据系统提示填写项目信息、上传甲方营业执照，并上传待审核的合同电子版及相关附件等。

4.请注意，如果“用章信息”处没有自动关联用章文档，可手动上传，否则下一步不能打印用章审批单。

第二步，审核、盖章

5.提交合同后，由学院审核员、横向管理员、法务（如需要）依次审核，全部审核通过后，系统会显示“学校通过”。

6.审核通过后，点击打印用章审批单，项目负责人须签字。然后携用章审批单和纸质合同，到上海大学一站式服务中心3-3科研管理部窗口盖“上海大学合同专用章（1）”。注意：除了合同落款页盖章，还要加盖骑缝章。

用章审批单样本如图所示：

如不能打印用章审批单，请返回查看第一步第4条。

*7. 横向合同如果应甲方要求，需加盖学校行政公章或法人章时，则还需通过PIM系统提交用印申请，审核后至上海大学一站式服务中心2-1党政办窗口用章。（*这一步不是必须的）

第三步，合同归档

8. 合同甲方、乙方单位都盖好章后，项目负责人在盖章页签字，扫描一份清晰的双章合同扫描件（含主合同、合同中提及的附件），将PDF上传至科研管理系统“双章合同”处；并提交纸质版合同至横向管理员处，用于合同归档。

理工类横向合同请交至科研管理部项目管理中心（行政楼503）：

张会文：技术开发合同，1份；技术转让合同，3份

徐恒：技术服务/咨询/购销合同等，1份

合同电子版、纸质版经横向管理员审核无误后，进行归档。归档成功后，科研系统中会生成正式合同序号，如“2026(科合)00 XXX”，企业微信中也会有短信提示。至此，进账合同立项完成。

9.下一步项目负责人可进行入账、预开发票等操作。（注意：具体内容可参考“上大财务”微信公众号推文“科研经费入账开票一次都不用跑啦”相应说明。）

2、理工科横向绩效提取办理流程

项目负责人通过财务处网站下载、填写《上海大学理工科横向项目绩效支取申请表2026》，表格中根据项目进展状况，勾选“中期考核”或者“结题验收”。表格经项目负责人签字，学院签字、盖章之后，提交至科研管理部项目管理中心（行政楼503）进行审核，审核通过并盖章后，和报销材料一起提交至财务处报销。

注意：横向项目应由项目负责人根据项目进展及成员工作实际安排绩效支出，合理发放。

3、理工科横向项目结题结转及科研培育基金办理流程

第一步，办理结题

根据学校的相关办法的要求，横向科研项目完成以后应及时办理结题手续；超过一定年限的经费卡号，剩余经费应办理结转。

结题手续有两种方式：1）在每年上半年，以学院为单位统一办理，项目负责人将结题证明材料交给学院汇总；2）项目完成后，项目负责人自行通过科研系统中上传结题证明材料的扫描件。

结题证明材料形式，可以二选一：1）甲方单位盖章的结题证明或复印件（请备注经费卡号和项目负责人姓名）；2）结题确认表。项目负责人通过“科研管理部主页-下载专区-理工-理工科横向相关下载”下载、填写表格，学院签字、盖章。

第二步，办理结转

关于结转，项目负责人可以选择横向项目结题一次性奖励支取（财务处网站下载）；也可以根据培育申请的通知，申请科研培育基金，具体办理时间以每年科研管理部、财务的通知为准（一般为下半年）。

4、理工科横向项目变更负责人办理流程

需要下载、填写《横向项目项目负责人变更申请表》一式三份（科研管理部主页-下载专区-理工-理工科横向相关下载），由原负责人本人及所在学院签字、盖章，新负责人及所在学院签字、盖章，并提交至科研管理部项目管理中心（行政楼503）审核。

审核通过后，理工科横向管理员收取其中一份申请表，在科研系统中变更负责人信息。项目负责人还需要去财务处交一份申请表，变更经费卡到新负责人名下，剩下一份申请表自留。

5、理工科横向补充协议、报价单等用章材料办理流程

项目负责人通过“科研管理部主页-下载专区-理工-理工科横向相关下载”下载、填写《用章审批单》，携用章审批单和待审核的补充协议或报价单等用章材料至学院，进行审核并签字、盖章后，再携以上材料到科研管理部项目管理中心（行政楼503）理工科横向管理员处进行审核。根据情况，横向管理员签字同意用印，或转给法务继续审核。

审核都通过后，可携用章审批单和补充协议至一站式服务中心三楼3-3科研管理部窗口盖章。（注：如果希望减少修改次数，可以在学院审核前，提前联系横向管理员对补充协议草稿进行预审）

补充协议盖好章之后，项目负责人需要提交一份原件给横向管理员，将扫描件上传至科研系统中该横向项目的“文档+”栏目。

6、理工科横向项目预算调整办理流程

根据《上海大学科研项目与经费管理办法（上大内〔2025〕141号）》附件2理工类横向科研项目经费使用规定第三条“若合同中无明确约定，直接费用为留校经费的67%，间接费用为留校经费的33%。”，第五条第（三）项规定“项目在研期间，在足额提取学校间接费用后，其余间接费用可根据项目需要调减用于直接费用，原则上仅限调整一次，间接费用不可调增”。

（1）理工科横向项目如需调整预算，项目负责人可填写《理工科横向科研项目预算调剂申请表2025》（财务处/科研管理部网站下载），到财务处进行调整。间接费用（绩效部分）最高不超过25%。

（2）理工科校内培育项目如需调整预算，办理流程和横向项目一样，由项目负责人填写表格，到财务处进行调整，原则上仅限调整一次。校内培育项目的间接费用可调减/调增，最高不超过80%。

7、理工科横向项目外协公示办理流程

根据《上海大学科研项目与经费管理办法（上大内〔2025〕141号）》附件8-科研项目外拨经费使用规定：

第六条：“横向科研项目立项前，项目负责人需填写《上海大学横向项目外协公示申请表》，提交学院签字盖章后，至科研管理部备案并公示（3个工作日）。公示无异议后，可以进行后续合同的审核、签订、立项等流程。

第七条：“横向科研项目外协经费原则上不得超过项目总经费的50%；超过50％且小于80％的项目，需科研管理部部务会讨论决定；达到80％及以上的项目，需申请分管校领导审批。”

常见问题

1、学校有合同模板吗？

学校科研管理部网站上有四技合同模板（技术开发、技术服务、技术咨询、技术转让），是由上海市科学技术委员会、上海市工商行政管理局制定的。可通过“科研管理部主页-下载专区-理工-理工科横向相关下载”进行下载。

所有合同中的“合同法”均已替换为“民法典”，下载使用即可，如合同中仍出现“合同法”字样的，审核时将全部退回修改。

不使用标准模板，或使用甲方模板的合同，横向管理员在审核时，将视合同具体情况对合同类型进行调整。

2、横向进账合同应通过PIM系统还是科研管理系统提交审核？

横向进账合同应通过科研管理系统进行提交。只有通过科研系统审核的合同，才能归档并生成合同序号，后续才能申请经费入账。只通过PIM系统审核的合同不能归档，不能进行经费入帐操作。

横向合同原则上无需使用校行政章或法人章，如甲方要求使用，则须通过PIM系统提交用印申请，审核后至上海大学一站式服务中心2-1党政办窗口用章。

3、在科研管理系统上传的合同电子版需要甲方先盖章吗？

在科研系统提交审核时，上传的合同电子版应为双方拟定的合同草稿，审核通过后，再进行合同盖章。学校对甲方、乙方的盖章顺序没有要求。

4、合同提交以后，为什么一直没有审核通过？

合同需要经过学院审核员、横向管理员、法务（如需要）依次审核，全部审核通过后，系统才会显示“学校通过”。

如果一直没有审核通过，建议老师在系统中看一下审核状态，用鼠标点击蓝色字体“已提交”，看看审核到哪一步，可根据情况提醒学院审核员、横向管理员进行审核。一般情况下，横向管理员、法务会在工作日当天完成审核。

5、合同到哪里盖章，需要打印几份？

合同审核状态变为“学校通过”以后，打印用章审批单、负责人签字，并根据合同中约定的份数打印合同，到宝山校区一站式服务中心三楼3-3科研管理部窗口用章。（注：寒暑假盖章地点请根据科研管理部工作提示）

常见的合同份数是4份或6份，甲乙双方各持2到3份。

6、合同需要交几份原件进行归档？

理工科横向合同需提交1份纸质合同进行归档，应提交合同原件或正本。（特殊情况：技术转让合同需要交3份纸质合同）

理工科横向合同请提交至科研管理部项目管理中心（行政楼503）横向管理员处，或请一站式科研管理部窗口的值班老师代为转交。

注意：寒暑假期间如需归档，可先将合同交给一站式科研管理部窗口的值班老师，再联系横向管理员进行线上归档。

7、合同双章扫描件在哪里上传？扫描要注意什么？

在“科研管理系统-横向项目列表-操作-上传双章合同”处上传。

合同扫描件是合同认定、合同归档的重要材料。扫描时，要注意页面完整、清晰、字体朝上；要按页码顺序，一页一页进行扫描，不能两页一起扫；盖章页应有负责人签名；对方单位公章上的单位名称应与合同里的单位名称完全一致，公章要清晰；合同中如果提及附件，则附件的扫描件也要一并上传。扫描件如果不规范，会影响合同认定结果。

8、申请预开发票或入账时，为什么科研系统提示合同未归档？

未归档有两种情况。一种是缺合同纸质版或电子版，及时补交即可；一种是已提交了合同纸质版、电子版，但因为技术开发合同须进行合同认定登记，合同认定登记成功后（一般需1-2周的时间），横向管理员才会进行归档操作。

归档成功后，科研系统中会生成正式合同序号，如“2026(科合)00 XXX”，企业微信中也会有短信提示。

9、横向进账合同的学校管理费比例是多少？

理工科横向进账合同的学校管理费比例是8%。

10、横向进账合同哪些部分不缴纳管理费？

根据《上海大学科研项目与经费管理办法（上大内〔2025〕141号）》附件2理工类横向科研项目经费使用规定第三条，“外协经费不纳入科研工作量考核认定范围，不设间接费用。”即外协部分不缴纳管理费，同时不算科研工作量。

外协经费分为外协设备和外协服务。合同约定时，应约定具体金额和外协单位，外协金额不得超过合同总金额的50%。

11、横向进账合同的增值税是多少？

一般分三种情况。

第一种是免税的技术开发合同，通过技术开发合同认定后，可开具0%税率的增值税普通发票。

第二种是技术服务、咨询、购销、合作协议等其他类型合同，以及未通过免税认定的技术开发合同，开具3%税率的增值税专用/普通发票。

第三种是购销合同，开13%增值税专用/普通发票。

另，合同中约定的外协费用，外协服务费开具3%税率的增值税专用/普通发票，外协设备费开具13%税率的增值税专用/普通发票。

具体信息请咨询财务处，以财务处的解答为准。

12、横向进账合同如何办理免税？需要多长时间？

可以免税的合同只有通过认定的技术开发合同。（注意：技术开发合同中如有“软件”字样，则不能免税）

老师提交合同双章扫描件、纸质版以后，横向管理员会依序进行合同认定的提交。合同认定是提交给上海市技术市场办公室等部门审核，流程需要1-2周。

13、技术服务、技术咨询合同可以免税吗？

这两类合同不能免税。但横向管理员也会向上海市提交合同认定。

14、合同认定结果如何下载？

横向管理员会定期将上海市合同认定结果的PDF文件上传至学校科研系统，老师可自行到科研系统合同详情页面进行下载。如果页面上没有合同认定结果，可咨询横向管理员。

15、学校有补充协议的模板吗？

学校没有补充协议的模板，请自拟。

16、补充协议可以通过科研管理系统线上审核吗？

补充协议目前不能通过线上审核，需要线下办理。（见“常见流程5.理工科横向补充协议办理流程”）

17、横向项目办理结题以后，经费还能用吗？

横向项目办理结题以后，经费可以正常使用。横向经费的结题结转、申请培育基金以学校的具体通知为准。

18、横向项目结题以后，剩余直接经费可以一次性提取吗？

可以，一次性提取剩余直接经费需要满足结题条件，或合同期限到期满一年且和甲方无纠纷。

项目负责人填写《横向项目结题一次性奖励支取申请表（理工科类）》（财务处网站、科研管理部网站均可下载），学院签字、盖章，然后经横向管理员（行政楼503）审核、盖章，再到财务处进行报销。

另，如有剩余的绩效，填写横向项目绩效支取表即可。参考“流程2、理工科横向绩效提取办理流程”。